Ses recherches portent sur l'économie de la croissance. Avec Peter Howitt, il a été le pionnier du paradigme dit de la croissance schumpétérienne, qui a ensuite été utilisé pour analyser la conception des politiques de croissance et le rôle de l'État dans le processus de croissance. En 2001, Philippe Aghion a reçu le prix Yrjo Jahnsson du meilleur économiste européen de moins de 45 ans, en 2009 il a reçu le prix John Von Neumann et en 2016 il a reçu le prix de l'entrepreneuriat mondial.
